Marit begynte som daglig leder ved teaterhuset Avant Garden i Trondheim da hun var 20 år og har i dag etablert seg som en av Norges mest anerkjente regissører.
Hun har jobbet med alt fra store klassikere til moderne dramatikk, ballett, musikal, opera, film, TV og radio – og har utallige regioppdrag bak seg fra nær sagt alle landets teatre. For Nationaltheatret har hun satt opp Genanse og verdighet (2000), Mikromani (2003), PippiLangstrømpe (2005), Fluenes herre (2010), Engler i Amerika (2018) og Krenket (2019). Mange av hennes regioppgaver har vært dramatiseringer av norske romaner. Blant dem er Linn Ullmanns Nåde for Riksteatret i 2006, Olaug Nilssens Få meg på, for faen og Vi har så korte armar for Det Norske Teatret i 2007 og 2011, Vigdis Hjorths Leve posthornet! for Riksteatret i 2014 og Agnes Ravatns Fugletribunalet for Det Norske Teatret i 2015.
Hun har regissert musikaler som Skyfri himmel med Bjørn Eidsvågs sanger og Olaug Nilssens manus for Rogaland Teater i 2006 og Halve kongeriket, skrevet av Are Kalvø og Ingrid Bjørnov for Det Norske Teatret i 2015. Ikke minst har hun gjort seg bemerket som ballettregissør, med Ghosts – Ibsens gengangere ved Den Norske Opera & Ballett i 2014 og Hedda Gabler i 2017 – begge med stor internasjonal suksess. Ghosts – Ibsens gengangere ble nominert til den anerkjente ballettprisen Prix Benois de la Danse og ble belønnet med Årets premiere i magasinet Dance Europe. I 2019 hadde hun regi på The Lady from the Sea, et samarbeid mellom The Norwegian Ibsen Company og The Print Room at the Coronet i London. Fra 2019–2021 hadde hun regi på Peer Gynt på Gålå.
For NRK har hun har laget tv-suksessen Harry & Charles (2009) og vært konseptuerende regissør for dramaserien Kampen for tilværelsen (2014) – et prosjekt som ble priset med Gullruten. Hun har også regi på Viaplay-serien Made in Oslo (2022) og Milliardærøya (2024) på Netflix.
Priser i utvalg: Heddaprisen i åpen klasse (2001), Skandinavisk Nasjonalteaterpris (2001), Gullsekken (2009) og Liv Ullmann-prisen (2012).
Moum Aune er for tiden husregissør ved Nasjonalballetten og har i juni 2022 premiere på En midtsommernattsdrøm med Nasjonalballetten ved Den Norske Opera & Ballett.